Identificação da região pseudoautossômica do cromossomo X em ovinos e pre-dição de sexo usando a montagem do genoma ARS-UI_Ramb_v2.0
DOI:
https://doi.org/10.31285/AGRO.29.1587Palavras-chave:
ARS-I_Ramb_v2.0, região pseudoautossômica, predição de sexo, cromossomo XResumo
A determinação do sexo por genotipagem é uma ferramenta eficiente para verificar o sexo registrado. Como os machos possuem apenas um cromossomo X, os genótipos heterozigotos não devem estar presentes na região não pseudoautossômica (nPAR) do cromossomo X. Portanto, determinar os limites da região pseudoautossômica (PAB) é necessário para uma predição confiável do sexo. Embora seja recomendado usar SNP dos cromossomos X e Y, o chip SNP que usamos não continha marcadores do cromossomo Y. Este estudo teve como objetivo determinar a região pseudoautossômica (PAR) no cromossomo X em ovinos usando o genoma ARS-UI_Ramb_v2.0 e testar um método para predição de sexo baseado apenas em SNP do cromossomo X. Para definição da região PAR foi utilizada uma população de treinamento de 210 ovinos genotipados com o Ovine Infinium® HD SNP BeadChip e para validação, 229 ovinos genotipados com o OvineSNP50 BeadChip. Após controle de qualidade, observou-se que a região PARse estendia de 0 a 7,24 Mb, identificada por SNP que exibiam altas taxas de heterozigosidade em machos. A abordagem proposta, que usa apenas SNPs do cromossomo X, atingiu uma exatidão de predição de sexo de 94%, com taxas de precisão de 99% para machos e 89% para fêmeas. Este estudo mostrou que a predição de sexo em ovinos pode ser feita usando apenas SNP da região nPAR do cromossomo X. Este é o primeiro estudo que usou esta abordagem especificamente usando o genoma ARS-UI_Ramb_v2.0.
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