Identificación de especies de lombrices en Uruguay en base a métodos morfológicos y moleculares

  • Gabriella Jorge Escudero Universidad de la República, Facultad de Agronomía, Departamento de Suelos y Aguas. Garzón 780, 12900 Montevideo, Uruguay. https://orcid.org/0000-0002-2961-8846
  • Jan Lagerlöf Universidad Sueca de Agricultura (SLU), Departamento de Ecología. P.O Box 7044, SE-75007, Uppsala, Suecia. https://orcid.org/0000-0003-2242-806X
  • Claudio Martínez Debat Universidad de la República, Facultad de Ciencias, Sección Bioquímica. Iguá 4225 Esq. Mataojo , 11400 Montevideo, Uruguay. https://orcid.org/0000-0003-3015-0117
  • Carlos Alberto Pérez Universidad de la República, Facultad de Agronomía, EEMAC, Departamento de Protección Vegetal. Ruta 3 km 363, 60.000 Paysandú, Uruguay. https://orcid.org/0000-0003-1907-6745
Palabras clave: COI, secuenciación, lombrices nativas y exóticas

Resumen

Las técnicas moleculares podrían ayudar a la identificación de especies de lombrices, especialmente cuando los caracteres morfológicos resultan difíciles de discernir. Basado en una colección de lombrices generadas a partir de muestreos en diferentes suelos agrícolas en Montevideo y Paysandú, Uruguay, este estudio representa un primer acercamiento al uso del barcoding del ADN como una herramienta para la determinación de la diversidad de lombrices en Uruguay. Las especies se identificaron tanto por caracteres morfológicos como por técnicas moleculares. Los individuos adultos se identificaron por morfología externa siguiendo las descripciones disponibles de las lombrices presentes en la región. De cada especie morfológica se obtuvo una muestra representativa para extracción de ADN genómico, con posterior amplificación y secuenciación de la región mitocondrial Citocromo Oxidasa I (COI). Las secuencias obtenidas se sometieron a búsquedas BLAST y fueron comparadas con las secuencias disponibles en GenBank. De 11 especiesexóticas secuenciadas, ocho se identificaron completamente, encontrándose coincidencia entre caracteres morfológicos e información molecular; en tanto dos fueron menos consistentes, con un menor porcentaje de similitud; y una no logró ser identificada completamente debido a la falta de secuencias relacionadas cercanas en GenBank. Mientras la mayoría de las especies exóticas tenían secuencias representativas anotadas en GenBank, esto ocurrió sólo con una especie nativa, lo que demuestra la necesidad de desarrollar esta importante área a nivel regional. Los escasos registros de muestreos de lombrices en Uruguay, y la ausencia de estudios nacionales referidos a identificación de especies por secuencias de ADN, hacen de este estudio un puntapié inicial para una línea de investigación innovadora.

Publicado
2019-05-23
Cómo citar
1.
Jorge Escudero G, Lagerlöf J, Martínez Debat C, Pérez C. Identificación de especies de lombrices en Uruguay en base a métodos morfológicos y moleculares. Agrociencia Uruguay [Internet]. 23may2019 [citado 17jul.2019];23(1):1-0. Available from: http://agrocienciauruguay.uy/ojs/index.php/agrociencia/article/view/58
Sección
Protección vegetal